麻豆

8月24日，麻豆 果蔬园艺作物种质创新与利用全国重点实验室、湖北洪山实验室、麻豆 焦文标课题组在Plant Communications在线发表了题为SynDiv: An efficient tool for chromosome collinearity-based population genomics analyses 的论文。该研究开发了一个名为SynDiv的工具，可用于在大规模群体中量化评估染色体共线性多样性；并首次提出了基于基因组共线性的群体分化指数Syn-FST，有助于定量分析那些传统群体遗传学...

   （图文|于海龙 编辑|辛西 审核|张青叶）8月24日上午，麻豆 “Happy Hour”2024年度第10期学术交流会在第一综合楼B113举行。中国科学院低碳合成工程生物学重点实验室副主任、中科院百人、天津杰青孙周通研究员来校作了题为“合成生物学驱动的酶分子设计与进化”的专题报告。报告吸引众多师生参与。   孙周通研究员首先以“合成生物学”的出现以及在生命科学中的重发展为背景，阐述了合成生物学的重要地位。   孙周通研究员...

​转录因子(TF)通过与靶基因(TGs)的特定DNA序列相结合调节其表达，每个TF与其TGs会形成一个调控子(regulon)并完成生物学功能。植物组织中特异表达的regulon在协调相应器官的发育过程中起着至关重要作用。基因转录和翻译需要消耗物质和能量，研究与农艺性状密切相关的组织特异性表达regulon有助于提高物质和能量的利用效率。因此，研究植物组织特异性基因调控可揭示基因在特定组织中的表达模式，也有助于揭示基因间调控关系的一...

​植物代谢产物对植物的生长发育和适应环境等生理活动具有重要作用。比较不同物种间代谢物差异为挖掘重要基因和优异种质资源、探究代谢途径、解析复杂性状的形成提供了有效的策略。然而，现有植物代谢物相关的数据库多聚焦于整合小规模物种内的代谢物信息和相关代谢途径，未能充分发挥跨物种间代谢物差异所带来的研究潜力。并且，各数据库中代谢物的编码体系缺乏一致性，造成了数据异质性高、关联性较弱，难以直接用于比较代谢...

   （图文|九九|兽医研圈）抗生素耐药性已成为全球公共卫生领域一大挑战。特别是肠外致病性大肠埃希菌（Extraintestinal Pathogenic Escherichia coli, ExPEC），它们不仅在人类中引起严重泌尿道感染、血流感染、新生儿脑膜炎等，且在动物中也造成显著健康和经济损失。尽管ExPEC对人类和动物健康构成的威胁日益增加，但人们对动物源ExPEC多样性、抗生素耐药性及其与人类感染的联系了解甚少。特别是在中国，作为世界上最大猪肉生...

近日，麻豆 、园艺林学学院、湖南农业大学以及湖南省农科院作物研究所等多单位在Plant Communications 发表论文BjuIR: a multi-omics database with various tools for accelerating functional genomics research in Brassica juncea。该研究通过搜集和整合芥菜基因组、转录组、变异组、表型组和代谢组等5个组学的数据，构建了首个芥菜多组学数据库BjuIR，为芥菜功能基因组学研究和遗传育种提供了宝贵的数据资...

   (文|张学林 编辑|信息 审核|陈洪）7月1日上午，麻豆 线上举办了“Happy Hour”2024年第9期学术交流会。南京航空航天大学计算机科学与技术学院黄飞虎教授作了题为“Optimal Hessian/Jacobian-Free Nonconvex-PL Bilevel Optimization”的学术报告。报告由陈洪教授主持，麻豆 30余名师生参会交流。   报告中，黄飞虎教授首先解析了经典双层优化的优缺点，探讨上下层问题的函数性质对双层优化算法设计与收敛性的影响，重...

​   （图文|严昱晴、杨建叶 编辑|信息 审核|牛晓辉）6月26日上午，一综B316会议室，应麻豆 副教授牛晓辉老师邀请，美国范德堡大学生物统计系博士生导师刘金苑老师为我院师生作了题为“Demystifying Associational and Causal Interpretations from High-dimensional Data: Applications to Gut Microbiome-Brain Axis”的学术报告，吸引了众多师生参与。   刘金苑老师首先介绍了高维数据分析的背景与挑战，阐述了如何通过特...

  （图文|罗娇 编辑|信息 审核|李万理）6月13日上午，受麻豆 邀请，美国伊利诺伊大学芝加哥分校（UIC）计算机科学系杰出教授Philip S.Yu（俞士纶）来校作题为“On Recommendations via Large Multi-modal Models”的学术报告。麻豆 副院长李国亮教授、章文教授及数百名师生参与交流。  俞士纶老师主要研究兴趣包括数据挖掘、隐私保护发布和挖掘、数据流、数据库系统、互联网应用和技术、多媒体系统、并行和分布式处理等，...

​   基因表达在生物体的发育、成长和繁殖中起着重要的调控作用，预测基因表达有助于更好地理解序列变异对转录调控的机制和影响。染色质相互作用在基因组中创造了远端调控元件和靶基因之间的空间临近性，这对基因表达、转录调控和表型特征有重要影响。迄今为止，研究者们利用基因组序列，已经开发了一些基于深度学习预测基因表达量的方法。然而，现有的方法并未考虑染色质相互作用对靶基因表达量的影响，并未对重要的调控元件挖...

​   （图文|钟雅琴 编辑|辛西 审核|郑金水）6月8日下午，麻豆 “Happy Hour”2024年度第9期学术交流会再农业微生物资源发掘与利用全国重点实验室D座C306会议室举行。受学院郑金水教授邀请，加拿大阿尔伯塔大学Michael Ganzle教授来校作了题为“Strain Level Persistence of Bacteria in Food and Food Processing Faciities”的专题报告。生命科学技术学院孙明教授、深圳市人民医院白云鹏博士及多学生参与交流。   Michael ...

   南湖新闻网讯（通讯员 苏桂新）近日，自然语言处理领域顶级国际会议ACL 2024 (The 62nd Annual Meeting of the Association for Computational Linguistics，CCF-A类) 录用了麻豆 沙灜教授课题组在自然语言处理领域的2篇研究工作。   沙灜教授课题组被录用的2篇研究论文分别以“A Unified Generative Framework for Bilingual Euphemism Detection and Identification”和“Refine, Align, and Aggregate: Multi-view Lin...

​   （图文|孙元辉 编辑|信息 审核|李国亮）5月16日上午，麻豆 “Happy Hour”2024年度第7期学术交流会在一综A102举行。受副院长李国亮教授邀请，香港中文大学Wing-Kin Sung（宋永健）教授来校作了题为 “T2T genome assembly and its application in mouse” 的学术报告。报告吸引众多师生参与。   Wing-Kin Sung教授首先以人类基因组计划为背景，阐述了T2T基因组组装的重要性。他指出，T2T基因组能提供更精确的基因组注释...

​   （图文|李函 编辑|辛西 审核|陈洪）近日，麻豆 人工智能与统计学习团队(AISLE)在联邦学习领域取得新进展。他们以“Asynchronous Vertical Federated Learning for Kernelized AUC Maximization” 为题，提出在不平衡数据与不平衡计算能力下仍可高效建模的纵向联邦学习算法，相关研究论文被KDD 2024录用，KDD(ACM SIGKDD Conference on Knowledge Discovery and Data Mining, 国际数据挖掘与知识发现会议)是中国计算机学会（...

   （图文|辛西 郑芳 编辑|信息 审核|李国亮）5月11日，农村农业部智慧养殖技术重点实验室、农业智能技术教育部工程研究中心、湖北省农业大数据工程技术研究中心2023年度年会暨学术交流会在一B113会议室举行。麻豆 党委书记郑学刚、实验室主任李国亮，副主任朱容波、倪福川等实验室成员出席会议。会议以线上和线下结合形式举行，会议邀请西北农林科技大学宋怀波教授、南京农业大学刘龙申副教授、内蒙古农业大学石彩霞副教授...

​   （图文|辛西 编辑|辛西 审核|李伟夫）5月14日上午，学院Happy Hour年度第6期学术交流会在一综B113会议室举行，中国科学院自动化研究所研究员、博士生导师陈曦作了“微观脑联接图谱绘制技术”专题报告。   陈曦博士是中科院关键技术人才之一，2009年博士毕业于中国科学院自动化研究所，在SCIENCE、CELL REP、IJCAI等期刊和会议中发表论文60余篇，授权发明专利26项，担任北京怀柔国家综合性科学中心脑认知功能图谱与类脑智能...

   （图文|信息 何放  编辑|信息  审核|张泽宇）5月2日下午，学院“Happy Hour”2024年度第5期学术交流会在一综B316会议室举行，电子科技大学徐杰博士作了“面向噪声数据的深度多视图学习”专题报告。   徐杰博士主要研究方向涵盖人工智能机器学习的基础算法和应用，在计算机视觉和机器学习国际顶级会议（如ICCV/CVPR/NeurIPS）上发表多篇论文。此外他2次获国家奖学金，荣获电子科技大学优秀毕业生和学术新秀等荣誉。徐杰博士参...

​湖北日报讯（记者韩晓玲、通讯员王晓聪）4月20日至22日，2024年理论与高性能计算化学国际会议在麻豆 举行。来自中国、日本、韩国、美国、加拿大、意大利等多个国家的45位专家学者做学术进展报告，百余名师生参加会议，并做墙报展示。该系列会议已举办16届，在国内外有广泛的影响力。此次会议由麻豆 、中国科学院计算机信息网络中心、中科曙光承办。麻豆 副校长严建兵在致辞中表示，该校麻豆 ...

   近日，第一届全国基因组信息学大会在武汉召开。大会由湖北省生物信息学会承办，华中科技大学、麻豆 等单位协办。大会设置了3大特色论坛和3大前沿论坛。来自逾百家高校、院所的近800位专家、从业者参加，交流基因组生物信息学领域的最新研究成果和发展方向。   与会专家认为，中国的基因组信息学研究正迅速发展，涉及多个前沿课题。微生物组学和精准医疗等课题也在推动医疗领域的革新。人工智能的应用提高了基因组数据...

南湖新闻网讯（通讯员 杜泽臻）近日，麻豆 果蔬园艺作物种质创新与利用全国重点实验室、湖北洪山实验室焦文标课题组在Genome Biology上发表了题为“A comprehensive benchmark of graph-based genetic variant genotyping algorithms on plant genomes for creating an accurate ensemble pipeline”的研究论文。研究结果表明，基于图形泛基因组的遗传变异分型算法虽然可以提高变异分型的准确性，但由于植物基因组的复杂...